Способ как устранить проблему с отображением сайта на основе темы Bootstrap3 для Drupal 7. Как  создать субтему на основе Bootstrap3 я писал в статье Создание темы на основе Bootstrap 3 для Drupal 7.

Способ будет работать только при отключённом CDN и локальном расположении файлов фреймворка.

1. Скопировать в папку  templates своей темы файл  html.tpl.php​. Файл располагаеться в базовой теме мой_домен/sites/all/themes/bootstrap/theme/system/

2. Заменить строки:

<!-- HTML5 element support for IE6-8 -->

  <!--[if lt IE 9]>

    <script src="//html5shiv.googlecode.com/svn/trunk/html5.js"></script>

  <![endif]-->

На следующие:

<!-- HTML5 element support for IE6-8 -->

<!--[if lt IE 9]>

  <script src="/sites/all/themes/street/bootstrap/assets/js/html5shiv.min.js"></script>

  <script src="/sites/all/themes/street/bootstrap/assets/js/respond.min.js"></script>

<![endif]-->

3. Добавить строку  мета тег:

<meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=edge">

Всё!